光伏产业用地意见稿送审国土部 基本农田红线不能碰
从《十二五医学科技发展规划》到《十二五生物技术发展规划》,2011生物医药产业高起点开局,在政策的推动下,加快产业结构调整,鼓励技术创新,获得长足发展。
地球之友美国分部的埃里克霍夫曼表示:在对环境、人类健康和伦理风险进行全面而公正的评估前,绝对不能进行转基因蚊子测试。这家公司称这些测试将在2012年进行,可能将转基因蛾放归野外。
这种昆虫对卷心菜和其他作物造成危害。批评人士指出蚊子的食物来源下水道可能含有低水平四环素,为转基因蚊子的存活、交配和繁衍提供条件。Oxitec首席执行官哈登帕里指出他们从未试图向公众隐瞒信息。Oxitec计划将转基因蛾放归英国野外,用以遏制野生蛾的数量。蚊子能够将登革热病毒传染给人类。
地球之友、英国基因监察机构以及第三世界网络的一份联合声明警告称:咬人的转基因雌蚊可能对人类健康造成何种影响仍旧是一个未知数,例如对过敏症患者。在开曼群岛、马来西亚和巴西,他们已经进行实验,将转基因蚊子放归野外。据公司的一位发言人透露,CGI在2011年底进行LFR服务试点,正式启动定于2012年。
我们希望2012年第一季度能够推出带有几百个传感器的这种芯片的版本。目前的问题是,如果一个个体在一个基因上出现两个突变,那这两个突变是位于其中一个染色体拷贝上,还是两个拷贝上各有一个错误? 医生当然必须知道这些信息以便做出正确的诊断,Reid说。这些化学修饰就像是高速路上的减速带,当聚合酶对其进行驱动时,使得DNA的延伸变慢,或者有时候会变快,这取决于特定环境。454还为靶向测序提供了引物试剂盒,包括人类HLA区域扩增及白血病相关基因分析试剂盒(2012年推出)。
尽管实验表明其可以区分四种碱基并控制DNA的运动,但该技术目前还处在研发中,Roever说道。这降低了样品制备的费用,提高了读取密度及一致性,Gardner说。
) 454 Life Sciences Roche Life Sciences的454 Life Sciences也升级了它的测序平台。事实上,Illumina计划推出BaseSpace的应用商店,这样用户可以将新的算法加入到自己的数据分析流程中。而超越性的下一代升级有了更好的光学技术及更高密度的样品空间的支持将使上面说的数字提高到另一个数量级,到2015年实现每年测出1百万个基因组,Reid说道。[5] 通量提高,成本降低 Isaacson 写道,Jobs的测序花费了大约100,000美金。
第二种是简化的文库制备试剂盒,可以将一天或两天的操作简化至90分钟。在Walter Isaacson撰写的苹果创始人Steve Jobs传记中,我们知道Jobs在自己被诊断患有胰腺癌后,他对自己的癌症基因组进行了部分测序,试图找出一种进行靶向治疗的方法。当然,人类是双倍体,携带了两套染色体。Gardner说,Life Technologies的5500系列遗传分析系统也预计在2012年进行升级。
Reid补充说,LFR的另一个好处是能将公司的测序精度从10-5提高到10-7,或者说从每个二倍体基因组上60,000个错误降低到600个。推出之时,PGM采用称为314的芯片,在两个小时内可产生1,000万个碱基,每个读长为100个碱基,花费500美元。
[8]芯片通电之后,研究人员可以对纳米孔阵列进行动态组装,向纳米孔中添加DNA样并实施测序,同时可以依需要将这些DNA分子排出纳米孔。Reid说,以此长度序列,公司可以解决遗传学上的潜藏问题,即将不同的DNA链进行区分。
Life Technologies的半导体测序芯片 Life Technologies公司副总裁Mark Gardner解释说,一次运行产生10亿碱基数据得益于两个方面,一是芯片上传感器数量增加,314上传感器数为140万,现在是1130万,可产生至少500万个读长。不过,Reid说得益于更多摄像机和DNA芯片的更高效利用,CGI将要全面配备的一种新仪器将使公司的产能提高到每年100,000个基因组。) 据Stockton的说法,Illumina最近还宣称开发了三种新的用于NGS的工具。我预计,这会是一笔大生意,CGI科学顾问委员会成员、哈佛医学院遗传学家George Church如是说。他解释说,现有的技术无法做到,因为这些技术使基因组发生了重新装配,使得无法将一个特定的突变定位到某个特定染色体。去年,摇滚歌手Ozzy Osbourne对他的基因组进行了测序。
2012年,各大测序公司将相继推出新的技术,包括Complete genomics公司在内的各大公司的努力将使普通的实验室也有能力进行全基因组测序,人类基因组测序价格继续降低,精度继续提高。自那之后,测序价格陡降了两个数量级。
不过通过将片段标上标签,依片段的不同分子来源而进行标记,LFR技术则可以规避该问题。今年(2011年),Gibbs和同事们报告称,由一对14岁的患有多巴反应性肌张力障碍的异卵双胞胎全基因组测序结果鉴定出了这种疾病的分子病因, 从而改进了治疗策略。
例如,Illumina推出的MiSeq,这是一种新的测序设备,可在不必要使用该公司的高端HiSeq测序仪的时候使用。纳米孔技术 Oxford Nanopore公司正在开发两种纳米孔测序方法(链条法及核酸外切酶法,并已就后者同Illumina达成了商业化协议),公司拒绝评论其项目的进展状态,但一些在线信息显示此系统由一系列的可以相互通讯的测序节点形成一个网络结构,每个节点配置一个耗材仓库。
[6]据CGI的CEO Clifford Reid称,该公司现在的报价是每个基因组4,000美元,一个月可完成750个基因组,到2012年初可实现每月1,000个。不过这种云技术的真正美妙之处就是,它非常易于为使用者增加新的功能,他说道。通过使点样更为紧凑并从头尾双向同时进行读取,Wildfire将成像特征数量提到了5倍。目前试用用户可用到的最新318芯片又提高了输出能力,一次运行可产生10亿碱基的数据。
不过当下还有一位大牛没有参与到竞争中来,那就是第三代单分子测序公司Helicos BioSciences这些化学修饰就像是高速路上的减速带,当聚合酶对其进行驱动时,使得DNA的延伸变慢,或者有时候会变快,这取决于特定环境。
Gardner说,到2012年某个时候,读长将增加到400碱基,意味着318芯片理论上每次运行可以产出20亿碱基的数据,而价格仍是500美元。) 据Stockton的说法,Illumina最近还宣称开发了三种新的用于NGS的工具。
第二种是简化的文库制备试剂盒,可以将一天或两天的操作简化至90分钟。其中的一件就是Pacific Bioscience的PacBio PR的正式推出。
另一个专注于纳米孔的公司Genia也迈出了它们商业化的第一步。在(2011年)二月份,Kevin Davies在《Bio-IT World》报道中称全基因组测序服务商Complete Genomics Inc.(以下简称CGI)的测序价格为每人9,500美元,8个基因组起测。据GenomeWeb Daily News报道,Helicos在11月14号宣称2011年第三季度的收入增长,但要小心因为缺乏现金注入而不得不在年底关门大吉。这降低了样品制备的费用,提高了读取密度及一致性,Gardner说。
[6]据CGI的CEO Clifford Reid称,该公司现在的报价是每个基因组4,000美元,一个月可完成750个基因组,到2012年初可实现每月1,000个。推出之时,PGM采用称为314的芯片,在两个小时内可产生1,000万个碱基,每个读长为100个碱基,花费500美元。
当然,人类是双倍体,携带了两套染色体。Life Technologies的半导体测序芯片 Life Technologies公司副总裁Mark Gardner解释说,一次运行产生10亿碱基数据得益于两个方面,一是芯片上传感器数量增加,314上传感器数为140万,现在是1130万,可产生至少500万个读长。
彼时,该系统将可运行Wildfire chemistry,将在实验台上进行的模板制备(包括费时费钱的乳剂PCR步骤)工作转到了仪器中进行。Roever说,Genia的系统的核心是活性芯片,能够对各个孔进行独立读取和控制。
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